本校創立於西元1914年(大正三年)5月，原名「臺灣總督府臺南中學校」，為日治時代臺灣中南部最先設立之中學，且主要設定為日籍青年就讀，設備充實。西元1922年(大正十一年)，總督府更改臺灣教育令，學校設立日多，中等學校逐交由各州管理，本校亦更名為「臺南州立臺南第一中學」，時教職員多隸日籍，台籍學生僅佔十分之一而已。 二次戰後，民國34年12月8日奉令改為「台灣省立臺南第二中學」，12月28日正式接收。但因本校日藉員生多已遷返，臺灣籍學生為數寥寥，曾短暫奉准編入臺南一中，斯時校務陷於停頓狀態。且因第二次大戰炮灼滿目瘡痍，幸賴教育廳撥款修建，加上歷任校長慘淡經營，在質的方面獲日新月異之進步，量的方面，得日積月累之成果。民國87年2月1日因教育部门政策，本校奉令改制為「國立台南第二高級中學」。莘莘學子，濟濟一堂，沐風化雨，弦歌不輟，造就不少英才。 校務方面，日治時期首位校長廣江萬次先生開始二中校務運作，之後由多位日籍校長先後接掌二中校務。民國34年12月本校已由首任非日籍校長蘇惠鏗接掌本校，教育廳於民國35年7月指派姜子榮校長接任本校，積極重整校容、推展校務，當時的學生計有高中部兩班，初中部四班，學生總人數263名，教職員工11人。民國42年9月，本校奉准設立山地補習班，招收國校(小學)男女畢業生。同年12月8日，本校校刊「南二中青年」創刊號發行。 民國43～50年由周簡文校長任內，民國44年7月3日奉准籌設台南市三省中聯合分校，地點選在台南縣善化鎮，男女兼收。民國45年聯合分部獨立，改為省立善化中學。又本校特於台南縣永康鄉設立分校，專收初中男生。民國48年全國大專聯考，本校李清木同學榮獲全國狀元頭銜，民國49年全國科學展覽本校榮獲冠軍。民國50年8月，推行「省辦高中，縣(市)辦初中」，本校奉命專辦高中。 民國50年12月廖傳淮校長就任，民國51年韓聖賢同學於大專聯考榮獲丙組魁首。 民國53年8月李昇校長就任，任內於57學年度高中教育評鑑中，本校榮獲台灣南區最優學校（全台灣第二名） 民國58年2月，羅旭升校長題「止於至善」為本校校訓，並逐步完成本校生物館、圖書館及各項校內設施。民國71年2月，鄭繼孟校長拆除日治時所建之體育館，改建為現今之明德堂。 民國74年12月黃炎祥校長就任，任內奉教育部门指定本校為高中示範圖書館，並配合該年校慶出版「台南二中學報」創刊號。76學年度因生活教育績優，榮獲教育部门獎，科學展覽應用科學高中組也榮獲第一名。並於任內民國77年8月1日，奉准設立美術實驗班，為中南部第一所實施美術資優教育的學校。 民國79年8月，蔡瑞榮校長就任後，在教學資源上增設了電腦教室、視聽教室、語言教室，充分利用媒體進行教學活動，逐步完成全校電腦網路連線，並裝置BBS專線；另籌募「台南二中文教基金」一千萬元，以孳息辦理獎助學金。民國83年亦興建科學館，增加天文台等週邊設備。民國82年蔡校長舉行創校八十週年慶，特舉辦「傑出校友表揚大會」，計有中研院院士許倬雲先生等31人接受表揚。二中莘莘學子於社會上士農工商各有優越表現，二中與有榮焉！ 民國84年8月陳國偉校長就任。陳校長秉持「師長為先，學生為重」的信念，締創出歷年遞增的升學率。民國85年更配合成功大學資訊系統，成為全省省中第一所連接上台灣學術網路的學校，86年起擔任台灣省高級中學推展資訊教育重點學校。民國87年完成藝能大樓興建。 民國90年8月1日，二中教務主任郭伯嘉經由甄選榮任第十三任校長，他以服務教育界多年的歷練幹才，為這一所歷史悠久的學府，辛勤耕耘，使本校展現了兼具傳統與創新的煥然風姿，並於97年4月將仁愛樓改建完成。民國97年8月1日，王榮發經由甄選榮任第十四任校長。 學制方面，本校在日治時代為五年制男子中學，國民政府來台後改為三三制完全中學。民國44年配合政府戰時疏散決策，曾與臺南一中、臺南女中兩校籌設聯合分部於台南縣善化鎮，男女兼收。翌年，改為省立善化中學。旋又獨設分部於台南縣永康市，專供初中學生疏散就讀之用。民國58年8月政府推行省辦高中縣市辦初中政策，本校奉令專辦高中，台南市立中學高中三班學生轉入本校，本校永康分部初中十三班學生移交省立新營中學接辦。 在人數上，本校在日治時代學生凡十五班，歷年畢業者五年制二十七屆，四年制一屆，計日籍學生2106名，臺籍270名。國民政府來台之初，本校計有高中二班、初中四班，教職員工11人，學生265人，嗣後逐年增加，目前二中共有學生五十七班2257人；教師121人，教官8人，職員23人，工友12人。
学校地址：704台南市北區北門路二段125號
招生电话：06-2514526
